با توجه به مواد 541 و 27 قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری صنعتی جمهوری اسلامی ایران مصوب 1372 و ماده 65 قانون احکام دائمی برنامههای توسعه کشور، مواد 765 ،10 و 15 آییننامه نحوه استفاده از زمین و منابع ملی در مناطق آزاد تجاری صنعتی جمهوری اسلامی ایران مصوب 1372 و با عنایت به دولتی بودن سازمان منطقه آزاد تجاری صنعتی ارس و قائممقامی و جانشینی آن سازمان از طرف وزارتخانهها و مؤسسات دولتی و با لحاظ تبصره 2 ذیل ماده 11 قانون زمین شهری مصوب 1366 و نیز ماده واحده قانون معافیت وزارتخانهها و مؤسسات دولتی از پرداخت هزینههای ثبتی مصوب 1398، سازمان منطقه آزاد ارس از پرداخت هرگونه هزینههای ثبتی و معاملاتی بابت آمادهسازی و تفکیک و فروش اراضی معاف است. با وجود اینکه با عنایت به تشتت آرا در سازمان ثبت اسناد و املاک جمهوری اسلامی ایران در خصوص شمول و عدم شمول هزینه تفکیک بر معافیتهای مصرح در ماده واحده قانون معافیت وزارتخانهها و مؤسسات دولتی از پرداخت هزینههای ثبتی مصوب 1398، همچنین برداشتها و تفاسیر متعددی که در شمول یا عدم شمول معافیتهای مصرح در تبصره 2 ذیل ماده 11 قانون زمین شهری مصوب 1366 نسبت به منطقه آزاد تجاری صنعتی ارس صورت گرفته است، مستدعی است دستور فرمایید در این خصوص اعلام نظر شود.
نظریه مشورتی اداره کل حقوقی قوه قضاییه :
ماده واحده قانون معافیت وزارتخانهها و مؤسسات دولتی از پرداخت هزینههای ثبتی مصوب 1398 ناظر بر وزارتخانهها و مؤسسات دولتی است و شامل سازمان منطقه آزاد تجاری- صنعتی مصوب 1372 که به موجب ماده 5 قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری- صنعتی، شرکت دولتی است، نمیشود و سازمانهای یادشده تابع قوانین و مقررات خاص خود هستند. همچنین مطابق بند 338 قانون تنقیح قوانین مالیاتی کشور مصوب 30/10/1396، تبصره 2 ماده 11 قانون زمین شهری مصوب 22/6/1366 نسخ صریح شده است.